После проведения первого розыгрыша Кубка Лиги 2008/09 в регламент были внесены определенные изменения. Итоговый формат действует до сих пор (меняется лишь количество участников) и включает в себя пять раундов:

В первом раунде встречаются 18 команд из Сегунды. Они делятся на четыре группы: 2 группы по 5 команд и еще две группы по 4. Соперники играют по одному матчу, а в следующий раунд выходят победители и вице-чемпионы своих групп;

Во втором туре принимают участие 16 коллективов: 8 победителей предыдущей стадии, 5 команд, занявших место с 11 по 15-ое в предыдущем сезон Примейры, а также 3 неудачника, покинувшие высший дивизион по итогам прошлого сезона. Все участники делятся на две корзины, затем путем жеребьевки определяются пары, которые будут бороться за путевки в следующий раунд; 

В третьем раунде в борьбу вступают лучшие команды Португалии, занявшие места с 1 по 10 по итогам предыдущего сезона Примейры. Соперники вновь делятся на группы по принципу первого раунда, играя по круговой системе;

В четвертый раунд или полуфинал проводится на нейтральном поле;

Финал также проходит на нейтральном поле и состоит из одного матча;

При равенстве очков в группе лучшая команда определяется по следующему алгоритму:

Лучшая разница забитых/пропущенных;

Количество голов, забитых на выезде;

суммарный средний возраст всех игроков, выставленных во всех матчах группы;